淨化車間裝修工程潔淨度不合格的原因是多方面的，但究其根源，無外乎以下幾種情況：
一、潔淨車間裝修工程設計不合理
潔淨車間工程設計一般都有專業的設計院或潔淨工程公司來承接，很少出現設計問題不合理的原因，主要是一些不正規的公司，沒有承接無塵室的資質，設計不合理，在施工中偷工減料，使用的設備不合适，造成無塵室潔淨度不合格。另一個原因是，公司的套用方案，不符合生産要求，在設計上有缺陷，導緻清潔度不合格。
二、空調系統檢測時淨化自淨時間不足
潔淨車間工程在正常運行30min後開始進行驗證工作，運行時間過短将嚴重影響淨化效果，需延長系統淨化時間。
三、潔淨車間清潔不徹底
潔淨車間裝修工程在驗證之前，應對無塵車間進行全面的清潔，所有員工穿戴幹淨的服裝進入車間，對車間進行清洗消毒，确保車間的潔淨度。
四、空調系統清潔不徹底
淨化車間工程淨化系統不進行清洗，均會影響空氣潔淨等級。普通空調系統不是一次安裝完，多次安裝必然有一些污染物留在風管之中，如果不清理幹淨，就會直接影響空氣的清潔度，所以在安裝過程中要邊施工邊清洗，并在驗證之前進行24小時空吹。
五、過濾器實驗不當
無塵室工程不同的清潔程度要求使用不同的裝修材料，如果無塵室的清潔程度較高，使用低檔材料，則自然達不到清潔程度标準，特别是過濾器的選擇，要根據潔淨度标準，選擇合适的過濾器标準。
六、送氣管道或過濾器密封不良
無塵室工程如果施工比較粗糙，在驗收時就會出現局部不符合潔淨等級的情況，一般是風管和過濾器的問題，要找準漏點，找準漏點，密封好。
七、回風管或回風設計、調試不佳。
回風系統的設計問題也會影響空氣清潔度，如果沒有設計好，就需要做好調試工作，減少回風阻力，回風量要比送風量大，另外回風高度也會影響潔淨度。
